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營改增消除了重復征稅，由原來的道道征稅變成環環抵扣，整個產業鏈條和大部分企業總體上是減負的，但在抵扣鏈條上的某些環節和少數企業，暫時的、局部的稅負增加難以避免。如何解決這個問題，各方看法并不一致，這也成為推進營改增的一大難點。
爭相追求低稅率，增加改革難度
目前，增值稅有17%、13%、11%、6%四檔稅率，小規模納稅人按簡易征收辦法適用3%的征收率。其中，11%、6%兩檔低稅率，是為了順利推進營改增，實現試點行業和企業稅負平穩過渡而新增加的。
按照國務院批準的營改增試點方案，租賃有形動產等適用17%稅率，交通運輸業、建筑業等適用11%稅率，其他部分現代服務業適用6%稅率。
“服務業原來按3%和5%征收營業稅，納入營改增試點后分三類按不同的稅率征收，主要是考慮行業之間差異很大，進項抵扣不一樣。”上海財經大學公共政策與治理研究院院長胡怡建教授解釋說，像咨詢業、文化創意產業這類公司，進項成本主要是水電費、電腦設備、打印紙和辦公樓，可抵扣的部分很少，所以稅率不能太高，適用6%稅率;而交通運輸業有車輛、設備、燃油費作為進項，所以它的可抵扣率就高，適用11%稅率。
然而，隨著營改增的深入推進，稅率檔次過多引發的矛盾逐漸顯現：一是將納稅人劃分為適用不同的稅率，本身就是一個相當復雜的“工程”;二是現在企業跨行業經營、捆綁銷售的情況很普遍，有時一筆收入對應多檔稅率，究竟應當按哪檔稅率征收稅企意見不一，給實際操作帶來困難。
特別是試點行業適用哪檔稅率，更成為爭議的焦點。后續納入試點的行業都希望在稅率上“就低不就高”，千方百計爭取適用6%的低稅率，甚至已經試點的行業也要求稅率改為6%。這不僅增大了低稅率被濫用的風險，而且在一定程度上增加了改革的難度。
“低征高扣”易引發稅收漏洞
試點行業之所以爭相攀比，都想適用低稅率，一個現實考慮就是避免營改增后稅負增加，最好能夠確保減稅。“如果稅率按6%，只要有一些日常的進項抵扣，企業稅負大都是減少的;如果稅率是11%，企業就得花很大力氣在經營上作調整并加強內部管理，稅負才能平穩過渡。兩相權衡，有誰愿意冒這個險呢?”一家企業的負責人道出個中緣由。
那么，營改增的試點行業稅率都“就低”，按6%征收行不行?
“現行增值稅暫行條例規定的標準稅率是17%，目前制造業適用的基本上都是這一稅率。如果服務業營改增后都按6%的稅率，那么二、三產業之間的稅率差異將引發很多問題。”中國社科院財經戰略研究院稅收研究室主任張斌認為。
張斌分析，適用6%低檔稅率的試點企業，采購的不少物資和設備都是17%的稅率，這意味著企業在進項上抵扣的稅多，而在銷項上征收的稅少。這種“低征高扣”的情況，會導致企業形成大量留待抵扣的進項稅，自己的“抵扣指標”用不完，有些企業就會借此對外虛開增值稅專用發票，讓“下家”企業進行抵扣，從而產生稅收漏洞，造成國家稅款流失。
此外，從目前情況看，2013年營改增全國減稅已超過1400億元，未來隨著電信、建筑、房地產、金融等“大塊頭”行業納入營改增，總體減稅的力度將更大。如果再對試點行業都實行6%的低稅率，財政能不能承受這么大的壓力，也是需要考慮的問題。
“從國際上的發展趨勢看，世界上越來越多的國家增值稅實行單一的稅率，設置低稅率的國家越來越少。”張斌介紹，即使有的國家設置照顧性低稅率，也主要針對與居民基本生活密切相關的生活服務業。營改增涉及的面這么廣，試點行業都要求照顧，實行6%的低稅率顯然是不現實的。
多檔稅率將統一簡并
作為我國第一大稅種，目前增值稅收入占稅收總收入的比重約為30%;營改增完成后這一比重將上升到40%左右，征稅范圍涵蓋國民經濟各個行業。將現行17%、13%、11%和6%四檔稅率，合并成為一檔標準稅率，需要綜合考慮多種因素，科學合理設定稅率水平。
“現在看來，營改增可能要分為兩步走：第一步是將試點行業全部納入營改增;接下來還要對目前的多檔稅率進行簡并，逐步實現增值稅單一稅率。因此，即使試點行業現在適用了低檔稅率，也并不意味著將來稅率一直不變。”胡怡建說。
“可以肯定地說，標準稅率再怎么調整，也不會從17%一下子下調到6%。試點行業的適用稅率，應當盡量向標準稅率靠攏，而不是向6%的低稅率看齊。否則，到簡并稅率時試點行業的稅率還要往上調，企業需要再過渡、再適應才能達到稅負平穩，轉換的過程會拉得更長。”胡怡建表示。
財政部財科所副所長白景明指出：“目前，社會上對營改增存在不少認識上的誤區，總認為稅率高是個大問題。實際上，制造業一直實行17%的稅率，也沒出現稅負過重難以承受的情況;而服務業按3%或5%的稅率征營業稅，由于不能抵扣、存在重復征稅，稅負反而比制造業更重。”
前期營改增試點經驗表明，抵扣鏈條上的企業總體是減負的，某些環節和少數企業稅負增加只是暫時現象。隨著營改增全部試點行業納入進來，進項稅的抵扣范圍也將更大，再加上試點企業采取相應措施積極應對、周密籌劃，這個問題就能夠通過市場自身的力量得到解決。
“對企業來說，并非只有稅負下降，才算享到改革紅利。”波司登國際控股有限公司董事局主席高德康認為，改革增強了企業活力和市場競爭力，這才是更大的紅利。
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